Abstract
Amaç: Beyin omurilik sıvısı örneklerinden (BOS) elde edilen mikroorganizmaların ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi amaçlanmıştır.
Gereç ve Yöntemler: Ondokuz Mayıs Üniversitesi Çocuk Acil Servisi'ne 01/01/2021-01/01/2022 tarihleri arasında menenjit ön tanısı ile başvuran 138 hastanın BOS örnekleri alındı. BOS kültüründe üreyen bakterilerin tanımlanması ve antibiyotik duyarlılıkları VITEK 2 (bioMeriux, Fransa) otomatik tanımlama sistemi ile değerlendirildi. Kan kültürü sisteminde üreme saptandıysa örnek %5 kanlı agar, Eosin Methylene Blue agar ve çikolatalı agarda ekildi. Ayrıca Real-Time PCR yöntemi ile çalışan Smart Cycler (Cepheid, ABD) cihazı ile BOS örnekleri hem viral hem de bakteriyel etkenler açısından incelendi. Bu sistemde Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, Sitomegalovirüs, Herpes simpleks tip-1, Herpes simpleks tip-2, Human herpes virüsü tip-6 (HHV-6), Varicella zoster virüsü ve Epstein Barr virüsü ajanları tespit edildi.
Bulgular: 138 BOS örneğinin, %50,88'i erkek, %49,12'si kadındı. Hastaların yaş ortalaması 36 ± 55 ay idi. BOS örneklerinin 18'inde (%13,8) bakteriyel, 12'sinde (%9,2) viral etkenler saptanmıştır. Bakteriyel etkenlerde Staphylococcus epidermidis (%64,6), Staphylococcus aureus (%7,7) ve Streptococcus pneumonia (%6,9) ilk üç sırayı aldı. Viral ajanlar arasında en yaygın olanı HHV-6 idi ve onu Enterovirüsler izlemiştir.
Sonuç: BOS'ta sıklıkla görülen mikroorganizmaların profillerinin ve direnç durumlarının yıllar içinde değiştiği gözlenmiştir.
References
- Tunkel AR, Scheld WM. Acute meningitis. In: Mandell GL, Douglas RG, Bennett JE, eds. Mandell, Douglas and Bennett.s Principles and Practice of Infectious Diseases. Sixth ed. New York: Churchill Livingstone. 2005: 1083- 126.
- Gültepe B, Bayram Y, Güdücüoğlu H, Çıkman A, Berktaş M. Investigation of bacterial and viral meningitis agents with different PCR methods at a university hospital. Abant Med J. 2015; 4: 125-9.
- Kılıç I, Altuğlu I, Çiçek C, Pullukçu H, Bayram N, Şirin H, et al. Santral sinir sistemi enfeksiyonu etkeni enterovirusların RT-PCR ve hücre kültür yöntemleri ile saptanması. Mikrobiyol Bul. 2011; 45: 468-77.
- Günaydın M. Bakteriyal menenjitlerin laboratuvar tanısı. ANKEM Derg. 1994; 8(3): 291-4.
- Gürses N. Bakteriyel menenjitlerde tedavi ve proflaksi. ANKEM Derg. 1994; 8(3): 299-304.
- Akkaya O, Güvenç Hİ, Güzelant A, Kaya M, Yüksekkaya Ş, Opuş A, et al. Menenjit etkenlerinin real-time PCR yöntemiyle araştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2017; 47(3): 131-7.
- Soylar M, Altuğlu İ, Sertöz R, Aydın D, Akkyun F, Zeytinoğlu A. Ege Üniversitesi Hastanesi’ne başvuran santral sinir sistemi enfeksiyonu olgularında saptanan viral etkenler. Ege Tıp Derg. 2014; 53: 65-70.
- Duman Y, Yakupoğulları Y, Tekerekoğlu MS, Güçlüer N, Oltu B. Bir üniversite hastanesi laboratuvarında beyin omurilik sıvısında izole edilen mikroorganizmaların üç yıllık geriye dönük analizi. Dicle Tıp Derg. 2012; 39 (1): 70-4.
- World Health Organization: Initiative for vaccine research. Bacterial Infections. 2009 [http://www.who.int/vaccine_research/diseases/ soa_bacterial/en/index2.html]. WHO, Geneva.
- Schut ES, Gans J, van de Beek D. Community-acquired bacterial meningitis in adults. Review. Pract Neurol. 2008; 8(1): 8-23.
- Harrison LH. Prospects for vaccine prevention of meningococcal infection. Clin Microbiol Rev. 2006; 19(1): 142-64.
- Saez-LIorens X, McCracken GH Jr. Bacterial meningitis in children. Lancet. 2003; 361(9375): 2139-48.
- Özdemir H, Tapısız A, Çiftçi E, İnce E, Doğru Ü. Çocuklarda akut bakteriyel menenjit. Çocuk Enf Derg. 2010; 4(1): 9-14.
- Esel D, Doğanay M, Alp E, Sumerkan B. Prospective evaluation of blood cultures in a Turkish university hospital: epidemiology, microbiology and patient outcome. Clin Microbiol Infect. 2003; 9(10): 1038-44.
- Yurdakul AS, Calisir HC, Atasever M, Ordulu L, Ogretensoy M. Resistance to penicillin among the Streptococcus pneumoniae in Turkey. Eur Respir J. 2001; 18(2): 436.
- Fırat M, Ersoy Y, Esel D, Bayraktar M, Caylan R, Durmaz R. Antimicrobial susceptibility and serotype distribution of pneumococci strains isolated from meningitis patients. Mikrobiyol Bult 2006; 40(3): 169-77.
- Sümer Z, Bakıcı Z, Özüm Ü. Evaluation of the results of CCF samples investigated bacteriologically for one year in patients prediagnosed meningitis. C. Ü. Tıp Fakültesi Derg. 2000; 22(3): 127-30.
- Dadağlıoğlu S, Özbal Y. Menenjit ön tanılı hastalarda BOS'un bakteriyolojik incelenmesi. Erciyes Tıp Derg. 1992; 14(2): 236-43.
- Durmaz G, Bolatlı T, Kiraz N. Osmangazi Üniversitesi Tıp fakültesi'nde 1982-1993 yılları arasında yapılan BOS kültürlerinin sonuçlarının değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bül. 1994; 28(3): 223-7.
- Ulusoy S, Erdem İ, Dirim Ö, Karakartal G, Günhan C. Erişkinlerde akut bakteriyel menenjitler: 148 olgunun değerlendirilmesi. İnfeksiyon Derg. 1995; 9(1-2): 27-31.
- Yağcı A, Çıragil P, Topkaya A, Söyletir G. Marmara Üniver sitesi Tıp Fakültesi Hastanesi'nde yatırılarak izlenen hastalardan izole edilen mikroorganizmaların 1996 yılı analizi. İnfeksiyon Derg. 1999; 13(1): 39-42.
- Yanık K, Yılmaz H, Karadağ A. Infectious agents and antibiotic susceptibility isolated from CSF samples of the patients with prediagnosis of nosocomial and community-acquired meningitidis. Int J Basic Clin Med. 2014; 2(3): 131-7.
- Kocagöz S, Gür D, Uzun Ö. Türkiye'de stafilokoklarda metisilin direnci. 8. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi (6-10 Ekim 1997, Antalya) Kongre Program ve Özet Kitabı, s: 776.
- Sarinoğlu RC, Sağlık İ, Mutlu D, Baysan ÖB, Öğünç D, Çolak D. Beyin omurilik sıvısı örneklerinden saptanan viral etkenler. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2016; 46(4): 152-8.
- Çaycı YT, Daştan MSE, Vural DG, Bilgin K, Birinci A. Investigation of Agents by meningitidis panel in cerebrospinal fluid samples of patients with suspected meningitis. J Biotechnol and Strategic Health Res. 2021; 5(2): 98-104.
- Çiçek C, Pullukçu H, Kalfaoğlu H, Kahraman H, Saz EU. Akut menenjit kliniği ile başvuran hastaların bos örneklerinde viral etkenlerin erken tanısı. Flora. 2015; 20(4): 174-81.
Abstract
Aim: It was aimed to determine the microorganisms and antibiotic susceptibilities obtained from cerebrospinal fluid samples (CSF).
Material and Methods: CSF samples of 138 patients who admitted with a prediagnosis of meningitis to Ondokuz Mayıs University Pediatric Emergency Department between 01/01/2021-01/01/2022 was included. CSF cultures, identification of bacteria and their antibiotic susceptibilities were evaluated by VITEK 2 (bioMeriux, France) automated identification system. If the growth was detected by blood culture system, the specimen was cultivated onto the 5% blood agar, Eosin Methylene Blue agar and chocolate agar. Also, CSF samples were studied for both viral and bacterial agents with the Smart Cycler (Cepheid, USA) device working with Real-Time PCR method. In this system, Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, Cytomegalovirus, Herpes simplex type-1, Herpes simplex type-2, Human herpes virus type-6 (HHV-6), Varicella zoster virus and Epstein Barr virus agents were detected.
Results: Of the 138 CSF samples, 50,88% were male and 49,12% were female. The mean age of the patients was 36 ± 55 months. Bacterial agents were detected in 18 (13,8%) of the CSF samples and viral agents in 12 (9,2%) samples. Staphylococcus epidermidis (64.6%), Staphylococcus aureus (7.7%) and Streptococcus pneumonia (6.9%) took the first three places in bacterial agents. Among the viral agents, HHV-6 was the most common followed by Enteroviruses.
Conclusion: It has been observed that the profiles and resistance status of microorganisms frequently seen in CSF have changed over the years.
References
- Tunkel AR, Scheld WM. Acute meningitis. In: Mandell GL, Douglas RG, Bennett JE, eds. Mandell, Douglas and Bennett.s Principles and Practice of Infectious Diseases. Sixth ed. New York: Churchill Livingstone. 2005: 1083- 126.
- Gültepe B, Bayram Y, Güdücüoğlu H, Çıkman A, Berktaş M. Investigation of bacterial and viral meningitis agents with different PCR methods at a university hospital. Abant Med J. 2015; 4: 125-9.
- Kılıç I, Altuğlu I, Çiçek C, Pullukçu H, Bayram N, Şirin H, et al. Santral sinir sistemi enfeksiyonu etkeni enterovirusların RT-PCR ve hücre kültür yöntemleri ile saptanması. Mikrobiyol Bul. 2011; 45: 468-77.
- Günaydın M. Bakteriyal menenjitlerin laboratuvar tanısı. ANKEM Derg. 1994; 8(3): 291-4.
- Gürses N. Bakteriyel menenjitlerde tedavi ve proflaksi. ANKEM Derg. 1994; 8(3): 299-304.
- Akkaya O, Güvenç Hİ, Güzelant A, Kaya M, Yüksekkaya Ş, Opuş A, et al. Menenjit etkenlerinin real-time PCR yöntemiyle araştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2017; 47(3): 131-7.
- Soylar M, Altuğlu İ, Sertöz R, Aydın D, Akkyun F, Zeytinoğlu A. Ege Üniversitesi Hastanesi’ne başvuran santral sinir sistemi enfeksiyonu olgularında saptanan viral etkenler. Ege Tıp Derg. 2014; 53: 65-70.
- Duman Y, Yakupoğulları Y, Tekerekoğlu MS, Güçlüer N, Oltu B. Bir üniversite hastanesi laboratuvarında beyin omurilik sıvısında izole edilen mikroorganizmaların üç yıllık geriye dönük analizi. Dicle Tıp Derg. 2012; 39 (1): 70-4.
- World Health Organization: Initiative for vaccine research. Bacterial Infections. 2009 [http://www.who.int/vaccine_research/diseases/ soa_bacterial/en/index2.html]. WHO, Geneva.
- Schut ES, Gans J, van de Beek D. Community-acquired bacterial meningitis in adults. Review. Pract Neurol. 2008; 8(1): 8-23.
- Harrison LH. Prospects for vaccine prevention of meningococcal infection. Clin Microbiol Rev. 2006; 19(1): 142-64.
- Saez-LIorens X, McCracken GH Jr. Bacterial meningitis in children. Lancet. 2003; 361(9375): 2139-48.
- Özdemir H, Tapısız A, Çiftçi E, İnce E, Doğru Ü. Çocuklarda akut bakteriyel menenjit. Çocuk Enf Derg. 2010; 4(1): 9-14.
- Esel D, Doğanay M, Alp E, Sumerkan B. Prospective evaluation of blood cultures in a Turkish university hospital: epidemiology, microbiology and patient outcome. Clin Microbiol Infect. 2003; 9(10): 1038-44.
- Yurdakul AS, Calisir HC, Atasever M, Ordulu L, Ogretensoy M. Resistance to penicillin among the Streptococcus pneumoniae in Turkey. Eur Respir J. 2001; 18(2): 436.
- Fırat M, Ersoy Y, Esel D, Bayraktar M, Caylan R, Durmaz R. Antimicrobial susceptibility and serotype distribution of pneumococci strains isolated from meningitis patients. Mikrobiyol Bult 2006; 40(3): 169-77.
- Sümer Z, Bakıcı Z, Özüm Ü. Evaluation of the results of CCF samples investigated bacteriologically for one year in patients prediagnosed meningitis. C. Ü. Tıp Fakültesi Derg. 2000; 22(3): 127-30.
- Dadağlıoğlu S, Özbal Y. Menenjit ön tanılı hastalarda BOS'un bakteriyolojik incelenmesi. Erciyes Tıp Derg. 1992; 14(2): 236-43.
- Durmaz G, Bolatlı T, Kiraz N. Osmangazi Üniversitesi Tıp fakültesi'nde 1982-1993 yılları arasında yapılan BOS kültürlerinin sonuçlarının değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bül. 1994; 28(3): 223-7.
- Ulusoy S, Erdem İ, Dirim Ö, Karakartal G, Günhan C. Erişkinlerde akut bakteriyel menenjitler: 148 olgunun değerlendirilmesi. İnfeksiyon Derg. 1995; 9(1-2): 27-31.
- Yağcı A, Çıragil P, Topkaya A, Söyletir G. Marmara Üniver sitesi Tıp Fakültesi Hastanesi'nde yatırılarak izlenen hastalardan izole edilen mikroorganizmaların 1996 yılı analizi. İnfeksiyon Derg. 1999; 13(1): 39-42.
- Yanık K, Yılmaz H, Karadağ A. Infectious agents and antibiotic susceptibility isolated from CSF samples of the patients with prediagnosis of nosocomial and community-acquired meningitidis. Int J Basic Clin Med. 2014; 2(3): 131-7.
- Kocagöz S, Gür D, Uzun Ö. Türkiye'de stafilokoklarda metisilin direnci. 8. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi (6-10 Ekim 1997, Antalya) Kongre Program ve Özet Kitabı, s: 776.
- Sarinoğlu RC, Sağlık İ, Mutlu D, Baysan ÖB, Öğünç D, Çolak D. Beyin omurilik sıvısı örneklerinden saptanan viral etkenler. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2016; 46(4): 152-8.
- Çaycı YT, Daştan MSE, Vural DG, Bilgin K, Birinci A. Investigation of Agents by meningitidis panel in cerebrospinal fluid samples of patients with suspected meningitis. J Biotechnol and Strategic Health Res. 2021; 5(2): 98-104.
- Çiçek C, Pullukçu H, Kalfaoğlu H, Kahraman H, Saz EU. Akut menenjit kliniği ile başvuran hastaların bos örneklerinde viral etkenlerin erken tanısı. Flora. 2015; 20(4): 174-81.
Details
| Primary Language | English |
|---|---|
| Subjects | Health Care Administration |
| Journal Section | Research Articles |
| Authors | |
| Publication Date | May 10, 2023 |
| Submission Date | November 11, 2022 |
| Published in Issue | Year 2023 Volume: 13 Issue: 2 |
